动物组蛋白H3K4三甲基化转移酶MLL3的生物信息学分析

[目的]对动物组蛋白H3K4三甲基化转移酶MLL3进行生物信息学分析。[方法]利用生物信息学的方法,对小鼠MLL3的基因结构、氨基酸序列、系统进化树、染色体定位和共线性等问题进行分析。[结果]编码合成的小鼠MLL3蛋白质一级结构包括7个锌指结构域、1个HMG-box(高迁移率族蛋白)、1个FYRN(N-末端富含苯丙氨酸或酪氨酸区域)、1个FYRC(C-末端富含苯丙氨酸或酪氨酸区域)、1个SET域和1个postSET域;从序列对比和同源性上发现,该研究中的19种动物都基本上具有这些结构,说明这些结构在进化上是相对保守的,其中SET域具有高度的保守性,是维持组蛋白甲基化酶活性所必须的;从系统发生上看,19种动物在进化树上的位置与其分类地位相一致;在共线性分析中,虽然小鼠和人的MLL3基因位于不同的染色体上,但其上游和下游具有相同的基因,说明小鼠和人的MLL3基因具有共线性。[结论]不仅揭示了MLL3的核苷酸序列及其氨基酸序列的一级结构,为以后研究其高级结构和蛋白质的功能奠定了基础;同时也为后期进行小鼠MLL3基因的引物设计、启动子分析、基因的克隆、定位和表达的调控模式研究奠定了基础。     

月季花瓣丝氨酸蛋白酶基因RhSep1的克隆及生物信息学分析

利用RT-PCR技术,从切花月季品种"Samantha"中克隆丝氨酸蛋白酶基因RhSep1。利用生物信息学技术对所得到的丝氨酸蛋白酶RhSep1序列进行结构与功能预测。结果表明:RhSep1基因全长2 442 bp,开放阅读框编码769个氨基酸,推定该丝氨酸蛋白酶分子质量为80.48 kD。通过NCBI和MEROPS肽酶数据库等对Rh-Sep1进行Protein Blast,发现RhSep1具有肽酶S8₃家族SA的典型结构域Petidase_S8₃（序列为Tyr-108-Leu-341）和PA_subtilisin_like的结构域（序列为Tyr-348-Ile-474）。预测RhSep1可能具有信号肽、明显疏水区和典型跨膜区,同时RhSep1氨基酸序列中存在较多蛋白激酶C和酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、豆蔻酰化位点。这些活性位点往往与蛋白的磷酸化、G蛋白相互作用等信号转导事件有关,RhSep1可能存在复杂的蛋白水平调控机制。     

家蚕丝氨酸蛋白酶BmHP14基因的克隆与表达模式分析

家蚕受到外源微生物侵染或损伤时,前酚氧化酶原级联反应中的起始丝氨酸蛋白酶会激活下游信号通路,最终产生黑色素。采用RACE技术,获得了家蚕前酚氧化酶原级联反应起始丝氨酸蛋白酶——血淋巴蛋白酶编码基因的全长cDNA序列,命名为BmHP14(GenBank登录号:JQ954757)。BmHP14 cDNA全长2 508 bp,开放阅读框为2 013 bp,编码670个氨基酸,预测蛋白质分子质量71 kD,等电点5.09,N端17个氨基酸预测为信号肽序列。多重序列比对显示BmHP14与烟草天蛾HP14的相似度很高,达到57%;分子进化树中二者也聚为一支。RT-PCR分析表明,BmHP14在家蚕5龄第3天幼虫脂肪体、马氏管、精巢、卵巢、表皮、血细胞、头部均有表达,其中以脂肪体中的表达水平最高。以黑胸败血芽孢杆菌、大肠杆菌、球孢白僵菌注射侵染家蚕5龄第3天幼虫,Real-time PCR检测显示在受到病菌侵染后,幼虫脂肪体中的BmHP14表达上调。Westernblotting检测结果显示,BmHP14在家蚕体液中以前体和成熟体的形式共同存在。研究结果提示,BmHP14是家蚕前酚氧化酶原级联反应信号通路中的关键酶。     

Identification of polymorphisms and association analysis with meat quality traits in the porcine KIAA1717 and HUMMLC2B genes

Skeletal muscle genes are potential candidates for production and meat quality. Screening a subtracted cDNA library constructed with mRNA obtained from longissimus dorsi muscles of F1 hybrids Landrace × Yorkshire and their female parents Yorkshire, we isolated two partial sequences coding for the H3-K4-specific methyltransferase (KIAA1717) and skeletal muscle myosin regulatory light chain (HUMMLC2B) genes. Database search revealed KIAA1717 and HUMMLC2B encoded proteins with SET domain and EF-hand calcium binding motif, respectively. In the present work we identified their partial polymorphisms and two SNPs, one (C1354T) at the 3′ untranslated region (UTR) of KIAA1717 and one (A345G) at the SINE (PRE-1) element of HUMMLC2B, both created/disrupted a restriction site for endonuclease Msp I. The selected pigs were genotyped at the KIAA1717 C1354T and HUMMLC2B A345G sites by means of a PCR-RFLP protocol. Significant associations were observed for the KIAA1717 C1354T polymorphic site with meat marbling (longissimus doris (p < 0.05), biceps femoris (p < 0.01)) and intramuscular fat (p < 0.01). HUMMLC2B A345G were significantly associated with meat pH (longissimus doris (p < 0.05), biceps femoris (p < 0.01)), drip loss (p < 0.01), water holding capacity (p < 0.01) and meat color value (longissimus doris (p < 0.01), biceps femoris (p < 0.05)). Further studies are needed to confirm these preliminary results.     

DNA甲基化与基因组印记

综合论述了DNA甲基化与基因组印记的最新研究进展,论述了它们的生物学意义,并阐述了两者的关系.     

Mast cell tryptase and asthma

As an important mediator of allergic inflammation, mast cell tryptase is involved in the in duction of hypersensitivity, infiltration of inflammatory cel s and t issue remodeling in respiratory tract.The effects of tryptase inhibitors on the actions of tryptase show further the potential of tryptase in the pathogenesis of asthma and its inhibitors in the treatment of asthma.     

丁基罗丹明B-Fe~(2+)-H_2O_2体系光度法测定蔬菜的抗氧化活性

研究了测定蔬菜抗氧化活性的分光光度法,用该方法测定了10种蔬菜提取液对羟自由基的清除率,结果表明,香菜、菠菜的抗氧化活性较强。     

蛹虫草与黄伞复合多糖抗氧化活性研究

[目的]研究蛹虫草与黄伞复合多糖的抗氧化活性。[方法]采用超声提取法分别提取蛹虫草多糖和黄伞多糖,并将二者按不同比例复合后,在不同浓度下进行羟基自由基的清除试验。[结果]在一定的剂量配比下,蛹虫草多糖与黄伞多糖表现出很好的复合效果,清除羟基自由基的能力较单独多糖有明显的提升。其中复合比例为2∶1,浓度为16 mg/ml时清除率较蛹虫草多糖提高了79.82%,是黄伞多糖的3.6倍;通过方差分析得出,复合多糖与单独多糖之间存在显著差异(P0.05),既表现出了较好的协同作用又呈现出很好的量效关系。[结论]复合后的多糖的活性提高,表现出了较好的清除羟基自由基清除效果。     

单羰基姜黄素类似物对Ⅱ型糖尿病大鼠非酒精性脂肪肝的治疗作用研究

[目的]研究单羰基姜黄素类似物(代号B06)对Ⅱ型糖尿病大鼠非酒精性脂肪肝糖脂代谢紊乱的影响。[方法]应用高糖高脂饲料喂养,小剂量STZ干扰建立Ⅱ型糖尿病大鼠模型[1],并随机分模型组、A75治疗组、C66治疗组、正常对照组,各组均灌胃治疗12周;检测各组大鼠血生化指标[2]。[结果]单羰基姜黄素类似物能明显改善试验性Ⅱ型糖尿病大鼠的血糖升高,FINS明显低于模型组;肝脏TC、血清TG、TC有明显的降低作用,对血清HDL有明显的升高作用,有统计学意义;[结论]单羰基姜黄素类似物对Ⅱ型糖尿病大鼠非酒精性脂肪肝有一定的治疗作用。